近日,南京農(nóng)業(yè)大學(xué)三亞研究院/動物科技學(xué)院王鋒教授團(tuán)隊(duì)在山羊骨骼肌發(fā)育的表觀遺傳調(diào)控機(jī)制研究中取得重要進(jìn)展,成果先后發(fā)表在Cellular And Molecular Life Sciences、International Journal of Biological Macromolecules、Meat Science和Journal of Cellular Physiology等國際主流學(xué)術(shù)期刊上。該研究較為系統(tǒng)的揭示了m6A修飾在山羊骨骼肌發(fā)育中的調(diào)控作用及機(jī)制,不僅豐富了表觀遺傳調(diào)控肌肉發(fā)育的理論,也為促進(jìn)肉羊育種和生長調(diào)控提供重要參考價值。
我國是全球最大的羊肉生產(chǎn)和消費(fèi)國,羊存欄量達(dá)3.26億(其中山羊約1.35億只),但并不是養(yǎng)羊強(qiáng)國。盡管山羊品種資源豐富,但普遍存在生長緩慢、產(chǎn)肉性能偏低等問題,缺乏優(yōu)質(zhì)肉用品種已成為影響當(dāng)前我國山羊產(chǎn)業(yè)高質(zhì)量發(fā)展的重要瓶頸。骨骼肌的生長發(fā)育與羊肉的產(chǎn)量和品質(zhì)密切相關(guān),深入探究山羊骨骼肌生長發(fā)育的調(diào)控機(jī)理,挖掘骨骼肌生長發(fā)育相關(guān)的分子遺傳標(biāo)記,有助于加快優(yōu)質(zhì)肉用山羊新品種培育。
N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)修飾介導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄后調(diào)控是當(dāng)前研究骨骼肌發(fā)育調(diào)控機(jī)制的熱點(diǎn)。近年來,王鋒教授團(tuán)隊(duì)系統(tǒng)地研究了m6A修飾調(diào)控山羊骨骼肌肌纖維形成的分子機(jī)制,并取得重要進(jìn)展,具體研究如下:
m6A是一種由m6A甲基轉(zhuǎn)移酶(METTL3、METTL14和WTAP等)和去甲基化酶(FTO和ALKBH5)動態(tài)調(diào)節(jié)的RNA表觀修飾,可在識別蛋白(YTHDF1/2/3、YTHDC1/2和IGF2BP1/2/3等)介導(dǎo)下通過調(diào)控RNA加工與代謝,參與各類生物學(xué)過程。王鋒教授團(tuán)隊(duì)通過對山羊骨骼肌肌纖維形成關(guān)鍵階段(齡胎75天和新生)的背最長肌進(jìn)行RNA-seq測序,發(fā)現(xiàn)3個差異表達(dá)的m6A識別蛋白,分別為YTHDF2、IGF2BP1和IGF2BP3,暗示它們可能參與m6A修飾在山羊骨骼肌發(fā)育過程中的調(diào)控。利用本團(tuán)隊(duì)建立的體外山羊成肌細(xì)胞分化模型,通過一系列功能研究,進(jìn)一步揭示了YTHDF2和IGF2BP1介導(dǎo)m6A修飾調(diào)控山羊骨骼肌肌纖維形成的作用機(jī)制:
YTHDF2通過識別STK11 mRNA-5′UTR的m6A修飾以及pre-miR378/378-5P和pre-miR-503-5p的m6A修飾,并與微處理器復(fù)合物(AGO2、DICER1和TARBP2)互作,促進(jìn)STK11 mRNA的降解以及pre-miR378/378-5P和pre-miR-503-5P的成熟來激活mTOR通路,進(jìn)而驅(qū)動成肌分化(International Journal of Biological Macromolecules,2023,2025;Cellular And Molecular Life Sciences,2024);
IGF2BP1能識別FGFR1 mRNA的m6A修飾,維持FGFR1 mRNA的穩(wěn)定性,并促進(jìn)其翻譯,進(jìn)而激活ERK通路促進(jìn)山羊成肌細(xì)胞增殖,而抑制其分化(International Journal of Biological Macromolecules,2024)。該項(xiàng)研究首次證實(shí)了YTHDF2介導(dǎo)m6A修飾的pre-miRNA成熟調(diào)控成肌分化,并強(qiáng)調(diào)了YTHDF2和IGF2BP1在山羊骨骼肌肌纖維形成過程中的重要調(diào)節(jié)作用,為深入理解m6A修飾如何轉(zhuǎn)錄后調(diào)控山羊骨骼肌發(fā)育提供新見解。
同時,本團(tuán)隊(duì)對新生和成年兩階段山羊各部位肌肉(腓腸肌、臂四頭肌、臀肌、背最長?。┑募±w維類型組成進(jìn)行比對分析,發(fā)現(xiàn)四個部位肌肉的肌纖維均以II型(快肌纖維)為主,且隨著年齡增長而變化,其中腓腸肌和臂二頭肌中II型肌纖維占比隨年齡增長而升高,而臀肌和背最長肌則與之相反,初步揭示了山羊骨骼肌發(fā)育過程中肌纖維類型轉(zhuǎn)化規(guī)律(Meat Science,2023)。另外,團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)環(huán)狀RNA circUSP13能促進(jìn)山羊肌管中慢肌球蛋白重鏈(MyHC-slow)表達(dá),而抑制快肌球蛋白重鏈(MyHC-fast)表達(dá)。進(jìn)一步機(jī)制研究表明,circUSP13通過MAPK/ERK信號通路促進(jìn)山羊骨骼肌中快肌纖維向慢肌纖維轉(zhuǎn)變(Journal of Cellular Physiology,2024)。這些研究結(jié)果為解析山羊骨骼肌肌纖維類型轉(zhuǎn)化分子機(jī)制提供新見解。
上述研究工作所發(fā)表論文,以南京農(nóng)業(yè)大學(xué)三亞研究院/動物科技學(xué)院為第一單位,王鋒教授、樊懿萱高級實(shí)驗(yàn)師為通訊作者,鄧凱平副教授、劉志鵬博士、蘇亞龍碩士和張真博士為相應(yīng)論文的第一作者或共同第一作者。上述研究工作得到國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目(2021YFD1200902)、國家自然科學(xué)基金(32202638)、江蘇省自然科學(xué)基金((BK20221018)、中國博士后面上基金(2022M721649)、中央高?;究蒲许?xiàng)目(KYQN2023004)和海南省揭榜掛帥項(xiàng)目(B21HJ1003)的資助。
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